Resumen rápido: ¿aplica Verifactu si estoy exento de IVA?

Si solo quieres la respuesta rápida antes de entrar en detalle, aquí tienes un cuadro resumen con los casos más habituales:

Situación ¿Debo cumplir con Verifactu?
Emito facturas y estoy exento de IVA (sanidad, formación reglada, etc.) Sí, si estás obligado a facturar
No tengo obligación de emitir factura No
Estoy en régimen de agricultura, ganadería y pesca (REAGP) sin facturar No, salvo excepciones
Facturo de forma ocasional pero uso un software de facturación Sí, el software debe estar preparado igualmente
Emito facturas exentas y no exentas (actividad mixta) Sí, para todas tus facturas
En resumen: estar exento de IVA no te libra de Verifactu. Lo que determina la obligación es si debes emitir factura y si usas un software para hacerlo, no si repercutes el impuesto.

Guía práctica paso a paso para autónomos

Con la entrada en vigor del sistema Verifactu en 2027, muchos autónomos y pequeñas empresas en España se preguntan si sus obligaciones fiscales cambiarán, especialmente aquellos que están exentos de IVA. Si formas parte de este grupo, es normal que te surjan dudas: “¿Tengo que enviar mis facturas a Hacienda aunque no repercuta IVA?”, “¿Me afecta Verifactu aunque esté en recargo de equivalencia o en el régimen de agricultura?”. Este artículo está pensado para resolver estas y otras preguntas, con un lenguaje claro y accesible.

Antes de continuar, te recomendamos leer la Guía completa de Verifactu 2026: qué es y cómo cumplir con él si aún no conoces el funcionamiento de este nuevo sistema.

Entonces ¿si estoy exento de IVA, debo enviar mis facturas a Verifactu?

La respuesta corta es: depende. No es lo mismo estar exento de IVA que no estar obligado a emitir factura, o formar parte de un régimen fiscal especial. Vamos a ver los matices.

Exenciones del IVA: ¿qué significa estar exento?

Estar exento de IVA significa que realizas una actividad económica que no está sujeta a este impuesto, según establece la Ley del IVA. Algunos ejemplos comunes:

  • Profesionales sanitarios (médicos, psicólogos, fisioterapeutas).
  • Profesores particulares.
  • Actividades relacionadas con la formación reglada.
  • Algunas actividades artísticas y culturales.
  • Servicios financieros y de seguros prestados por determinadas entidades.
  • Arrendamiento de vivienda habitual (cuando no hay actividad empresarial asociada).

En ninguno de estos casos desaparece la obligación de facturar si tu actividad la exige: simplemente la factura se emite sin repercutir IVA, indicando el motivo de la exención.

El criterio de obligación según la Ley Antifraude

La Ley Antifraude establece que deben enviar las facturas a Hacienda todos los que:

  • Estén obligados a emitir factura.
  • Utilicen un software de facturación (que debe ser compatible con Verifactu).

Por tanto, aunque estés exento de IVA, si emites facturas, estarás afectado por Verifactu. El criterio que usa Hacienda no es fiscal (cuánto IVA pagas), sino documental: si tienes que dejar constancia de una operación mediante factura, esa factura debe pasar por un sistema informático compatible con Verifactu.

Casos prácticos reales

Caso Exención de IVA Obligación de emitir factura Uso de software de facturación Obligación con Verifactu
Psicóloga autónoma Exenta por actividad sanitaria Sí Sí Sí
Agricultor en régimen especial (REAGP) Régimen especial No (salvo excepciones) No No
Profesor particular No obligado (si no hay actividad empresarial) No No No
Formador de cursos de formación reglada Exenta por formación reglada Sí Sí Sí
Autónomo con actividad mixta (exenta y no exenta) Parcial, según la operación Sí Sí Sí

¿Emites facturas con o sin IVA?

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Cómo saber si estás obligado a usar Verifactu

La obligación no depende tanto de si pagas IVA, sino de si:

  1. Estás obligado a emitir factura. Según el artículo 2 del Reglamento de facturación, deben emitir factura los autónomos y empresas por cada operación realizada, incluso si están exentos de IVA.

  2. Utilizas software de facturación. A partir de 2027, si usas software para realizar tus facturas, este deberá estar adaptado a Verifactu. Aunque no uses la opción de envío automático a Hacienda, el sistema deberá estar preparado para hacerlo.

  3. Estás en estimación directa o módulos. Independientemente de tu régimen, si emites facturas, debes enviarlas a Verifactu.

Consecuencias de no cumplir con Verifactu

  • Sanciones económicas. Hasta 50.000 € por software no adaptado. 5.000 € por cada factura no verificada si el software no cumple con la ley.

  • Imposibilidad de justificar ingresos. Hacienda puede no reconocer facturas emitidas fuera del sistema.

  • Problemas de reputación. Si trabajas con empresas o administraciones, querrán tener facturas verificables.

Recomendaciones para autónomos exentos de IVA

  1. Revisa si debes emitir factura. Hazlo según tu actividad. Si la respuesta es afirmativa, es muy probable que debas usar Verifactu.

  2. Consulta si tu software está adaptado. Pregunta a tu proveedor si cumple con Verifactu y la Ley Antifraude.

Sigue leyendo Certificados digitales necesarios para la factura electrónica y Verifactu

  1. Considera usar software adaptado. Si usas plantillas o un ERP como Holded con más módulos de los que realmente necesitas, podría ser momento de cambiar a una alternativa a Holded más simple, centrada solo en facturar. Te evitará sanciones y simplificará tu contabilidad.

  2. Habla con tu asesor fiscal. Él podrá confirmar si en tu caso concreto debes cumplir con Verifactu o no.

Preguntas frecuentes

¿Si emito facturas exentas de IVA estoy obligado a usar Verifactu?

En la mayoría de los casos, sí. La obligación de usar Verifactu no depende de si repercutes IVA en tus facturas, sino de si estás obligado a emitir factura y usas un software para hacerlo. Así, una psicóloga, un profesor de formación reglada o cualquier profesional exento de IVA que emita facturas deberá cumplir con Verifactu igual que cualquier otro autónomo. Solo quedan fuera quienes no tienen obligación de facturar, como ocurre en algunos casos del régimen de agricultura, ganadería y pesca.

¿Cómo se refleja la exención de IVA en el registro de Verifactu?

Cuando emites una factura exenta de IVA, tu software de facturación debe indicarlo en el registro que envía a la AEAT: la base imponible se declara sin cuota de IVA y se añade la causa de exención correspondiente (por ejemplo, exención por actividad sanitaria, educativa o cultural, según el artículo de la Ley del IVA que aplique). El QR y el registro inalterable de Verifactu se generan igual que en cualquier otra factura; simplemente el desglose de impuestos aparece a cero junto con la mención expresa de “operación exenta”. Un software certificado como YoFacturo aplica automáticamente el código de exención correcto para que no tengas que preocuparte por ello.

Diferencia entre exento de IVA y no sujeto en Verifactu

Aunque a menudo se confunden, no son lo mismo. Una operación exenta de IVA está dentro del ámbito del impuesto, pero la ley la libera expresamente de repercutirlo (por ejemplo, servicios sanitarios o educativos). Una operación no sujeta directamente no entra en el hecho imponible del IVA (por ejemplo, determinadas indemnizaciones u operaciones sin contraprestación). En ambos casos puede existir obligación de facturar, y si la hay, la obligación de cumplir con Verifactu se mantiene igual. La diferencia está en cómo se justifica y documenta la operación en la factura, no en si debes o no usar un sistema de facturación verificable.

Conclusión

El hecho de estar exento de IVA no te exime automáticamente de cumplir con Verifactu. Si emites facturas y utilizas un software de facturación, lo más probable es que debas adaptarte.

La clave está en determinar si tienes obligación de facturar. Y si es así, lo recomendable es dar el paso cuanto antes para cumplir con la normativa y evitar problemas con Hacienda.

Recuerda que puedes ampliar esta información en nuestra Guía completa de Verifactu 2026